L’intérêt des habitats prairiaux et forestiers est renforcé par la présence de bras secondaire, de bras morts, de mares temporaires ou non. Parmi les mares les plus intéressantes signalons celles du Bançon à Ovanche, de Charentenay, Mercey-sur-Saône, la Laie à Quitteur... Ces milieux abritent une végétation originale avec plusieurs espèces protégées. En l’absence de poissons, ils sont extrêmement favorables au développement des populations d’amphibiens parmi lesquelles il convient de mentionner le triton crêté et le crapaud sonneur à ventre jaune.